Er is geen behandeling voor houtskoolrot van komkommerachtigen. Fungiciden (zaad) behandeling en blad) bleken niet effectief te zijn bij de behandeling van deze ziekte. Voorgesteld wordt om gedurende 3 jaar af te wisselen naar een niet-waardgewas; de bruikbaarheid en doeltreffendheid hiervan is echter om een ​​paar redenen twijfelachtig.